由于结核菌素纯蛋白衍生物与卡介苗存在交叉反应，在接种卡介苗的人群当中，虽没有结核感染，也可以出现结核菌素实验皮试的阳性，可以视为这个实验的假阳性反应。
此外，由于潜伏结核感染和活动性结核菌存在对结核分枝杆菌的细胞免疫反应，所以现在不能凭借它来区分活动性结核感染或者是潜伏性的结核感染。而在一些免疫缺陷的患者当中，特别是有艾滋病毒或者是其它的情况下，这个实验可能会因为细胞免疫反应功能受损伤，而产生假阴性的结果。
结核菌素试验的意义有哪些
结核菌素实验，广泛应用于检出结核分枝杆菌的感染，而非检出结核病，结核菌素实验对于儿童少年和青年的结核病诊断具有参考意义。由于许多国家和地区目前广泛推行卡介苗接种，因此结核菌素实验阳性不能区分是结核分枝杆菌的自然感染，还是卡介苗接种的免疫反应，因此在卡间苗普遍接种的地区，结核菌素实验是结核分枝杆菌感染的检出受到限制。
目前who推荐使用的结核菌素为纯蛋白衍生物ppd和ppd-rt23，结核分枝杆菌感染后需要四到八周左右才会建立充分的变态反应，在此之前结核菌素实验可为阴性，另外营养不良，hiv感染麻疹、水痘、癌症、严重的细菌感染，包括重症结核病，如肃立性肺结核性、结核性脑膜炎等，结核菌素实验结果多为阴性或弱阳性。
结核菌素试验挂什么科
结核菌素试验是一种检查手段，如果想做此检查，可以挂结核病科，感染科。
结核菌素试验又称PPD试验，是诊断结核菌感染的一种方法，可用于结核疾病诊断或为接种卡介苗是否成功提供依据。主要操作为在上臂前臂屈侧或外侧中央无任何皮损的光滑处，注射结核菌素，然后用记号笔画圈标记此处。正常情况下皮肤会出现6-10mm白色凸起即皮丘，注意不要按压、揉搓。
医生注射后会测量并记录注射局部皮丘的尺寸，注射后48-96小时观察结果，需注意局部皮丘大小、有无硬结，及水疱、红疹等反应。正常结果为皮丘小于5mm、没有硬结，若出现硬结并伴有皮丘大于5mm则为病理反应。硬结为5-9mm为阳性，10-19mm为中度阳性，大于等于20mm为强阳性，伴发水疱、破溃等皮损为极强阳性，需注意保持局部皮肤干燥，避免搔抓，防止皮肤继续破溃、感染等。
做结核菌素试验，如果是医院有专门的结核病科，可以挂结核病科，如果没有，也可以选择挂感染科。
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