一般硫唑嘌呤可以适用于对糖皮质激素治疗效果不佳或者对糖皮质激素依赖的慢性持续性溃疡性结肠炎患者，加用免疫制剂后可以逐渐减少糖皮质激素的用量，甚至可以停用糖皮质激素。
对于严重的溃疡性结肠炎急性发作，静脉应用糖皮质激素治疗无效的时候，可以应用环孢素进行静脉滴注，大部分患者可以取得暂时性的病情缓解而可以避免急诊手术。一般溃疡性结肠炎缓解期控制炎症，主要是以五氨基水杨酸类药物作为维持治疗的，如果患者活动期的病情缓解是由于硫唑嘌呤等免疫抑制剂所诱导的，则应当仍需要应用相同剂量的这类药物来进行维持治疗。
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