中医治疗幽门螺旋杆菌感染主要通过两个方面来治疗：第一通过口服中药来治疗，改善人体的内环境，从而达到根除幽门螺旋杆菌感染的症状。第二是通过针灸的方式，通过疏通经络使胃部疾病症状得到好转，也可以间接的使幽门螺旋杆菌感染得到一定的治疗。
在临床上经常用到的中药，除中成药以外还可以用中药汤剂来进行治疗，其中要添加黄连，龙胆草，半枝莲，白花蛇舌草，蒲公英，百合，麦冬等等，一定要在医生的辨证指导下进行加减，对于纠正细菌的感染有很大的效果。治疗幽门螺旋杆菌感染，中医常用的中药有麦门冬汤，半夏厚朴汤，二陈汤，柴胡疏肝散。
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