双黄连和抗病毒口服液的主要区别是所含有的成分不同，性状不同，其功效和主治不同。双黄连口服液主要含有金银花，黄芩，连翘等，具有疏风解表，清热解毒的主要功效，可以用于外感风热所致的感冒，症见发热，咳嗽，咽痛。
抗病毒口服液主要含有板蓝根，石膏，芦根，生地黄，知母，石菖蒲，连翘等，具有清热，去湿，凉血，解毒的主要功效，可用于风热感冒，流感。根据患者的病情，需要在医生的指导下，来选择一种药物。
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