MDS和再生障碍性贫血的区别在于MDS是骨髓造血肿瘤性疾病，而再生障碍性贫血是骨髓造血衰竭性疾病，两者是完全不同的两种疾病。MDS和再生障碍性贫血虽然不是一类疾病，但是都可以表现为全血细胞减少，从而有反复感染，贫血和出血的临床表现。
另外，MDS和再生障碍性贫血的治疗手段也是不同的。MDS的治疗主要是去甲基化治疗、雄激素促造血治疗以及化疗、异基因造血干细胞移植。而再生障碍性贫血则主要是应用免疫抑制剂治疗，也可以应用雄激素促造血治疗，部分患者也可以考虑进行异基因造血干细胞移植。
再生障碍性贫血和地中海贫血的区别
再生障碍性贫血和地中海贫血的区别很大。再生障碍性贫血，是骨髓造血障碍引起的贫血、白细胞减少，还有血小板减少。地中海贫血它也是贫血的一种，是地中海沿岸的人类的后裔，由于基因突变导致红细胞，血红蛋白的合成出了问题，所以正常的血红蛋白是四条链，它的四条链，其中的出了问题以后，红细胞的结构就有问题，容易被破坏掉。所以患者的表现就是面色苍白、贫血，还有脾大。但它一定有一个地域性，有基因的问题，所以它是遗传性的血液病，遗传性的贫血，和再障是完全不一样的。
急性慢性型再生障碍性贫血的区别
急性就是起病比较急，发病也比较重，这种情况下叫做急性。严格来讲也不完全是时间的概念，它和病情的轻重也有关系。慢性的，时间很长，怎么也治不好，血象比如血色素也就八九克，血小板也就五六万，白细胞液就两三千，也不怎么影响生活。就是不怎么感染，也不一定非要输血，但血象就是不正常，孩子弱弱的，这个时候叫慢性再生障碍性贫血。所以一个是时间的概念，一个是病情的轻重，决定了是急性期还是慢性期。
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