核磁共振与脑功能成像区别在于检查的时间、疾病以及部位不相同。
1、检查的时间：
核磁共振一般是做全身核磁共振，同时也可以做脑部以及腰部核磁共振，需要的时间可能会长一些，在10分钟以上，甚至还有可能会更长，脑功能成像检查一般是做影像学检查，检查过程中时间比较短，在三分钟左右。
2、疾病不相同：
核磁共振可以检查全身疾病，比如脑部、腰部以及腿部等疾病，而脑功能成像主要是检查脑部疾病。
3、部位不相同：
核磁共振属于全身检查，比如头部、颈部、腰部以及腿部等，同时也可以检查肝脏、胰腺以及胆囊等，脑功能成像一般主要是做脑部。
在做检查前需要将身上的金属物摘取干净，避免在检查过程中出现不适现象，甚至还有可能会影响检查的正确结果。
增强ct与核磁共振区别
增强CT与核磁共振二者是截然不同的两种检查方法，都是放射科常用的影像学检查方法。增强CT是利用CT扫描设备，并注射造影剂后对感兴趣区的病变区域进行检查的一种方式。在注入增强造影剂后CT机扫描相应的部位，并采集不同时期的图像，通过对不同时期病变强化方式的观察，从而对病变进行更好的定性。
而核磁共振并不会产生放射，辐射损伤，是利用组织与器官原子核在磁场中的一种相互作用，而采集到的叫做信号。用信号转化为的一种可以给影像医师观察的图像进行分析。二者在成像原理和成像序列的表达上都是有区别的。
磁共振功能成像有哪些
磁共振功能成像主要包括弥散功能成像，质子加权功能成像，波谱成像以及现在应用比较多的灌注成像等等。
这里简单介绍一下磁共振的弥散加权成像，弥散加权序列成像，是利用核磁共振对脑组织的一种特殊序列扫描以后，可以发现该区域病变中水分子自由扩散率这个表现。
在有些早期的脑梗塞病人中，由于脑梗塞的区域出现了细胞毒性水肿，导致了水分子弥散受限，所以说通过弥散加权成像这个序列，就可以清晰的显示出这个弥散受限的区域，从而指导临床进行后续的相应治疗。
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