肝硬化：约80%的肝癌患者有肝炎后肝硬化。
病毒性肝炎：原发性肝癌患者中，约1/3有病毒性肝炎史，其中乙型肝炎与肝癌的关系最为密切。
真菌及其毒素：如黄曲霉素是自然界最强的致癌物，能引起肝癌。
化学致癌物：常见的有氯乙烯、亚硝胺类、有机氯农药等。其中，亚硝胺能在很多的动物中引起肝癌。
营养因素：研究发现，蔬菜、水果摄入能降低癌症的危险性。常饮咖啡是肝癌的一个保护性因子。硒是一种抑癌元素，硒可提高机体的免疫功能和解毒功能。硒的缺乏有助于肝癌的形成。如海带含硒量非常丰富。
免疫状态：有人认为肝癌患者血浆中含有一种封闭因子，能抑制细胞免疫并保护肝癌细胞不受免疫细胞杀伤。现已证明，肝癌产生的甲胎蛋白就有此作用。
遗传因素：肝癌有时出现家族集中发病现象。
其他因素：研究表明长期口服避孕药可增加肝腺瘤的危险，也可增加肝癌的危险。
原发性肝癌的原因
一、病毒性肝炎：这包括乙型和丙型病毒肝炎，推测其原因可能是肝炎病毒引起肝细胞损害继而发生增生或不典型增生，从而对致癌物质敏感，在多病因参与的多阶段的发病过程中可能有多种基因发生改变，其结果引起细胞生长失控，肝细胞持续增殖，最后导致癌变。
二、酒精：在西方国家，饮酒是慢性肝病病因中最主要的因素，但通过研究表明酒精和肝癌细胞无直接关系。它的作用类似于催化剂，能够促进肝癌的发生和进展。这是因为酒精影响了肝脏的正常代谢，引起肝内脂肪沉淀而造成脂肪肝。饮酒愈多，脂肪肝愈严重，若再大量酗酒，会大大加快加重肝硬化的形成和发展，促进肝癌的发生。
三、饮食：长期进食霉变食物、含亚硝胺食物，微量元素硒缺乏等都是促发肝癌的重要因素。其中存在于霉变食物中的黄曲霉素和腌制类食物中的亚硝酸盐为主要的致癌物质。
四、其他因素：如饮水污染、遗传因素、寄生虫感染等。
肝癌的发病原因
据我们国家大数据统计和普查，那么我们国家最常见的肝癌发病原因，还是乙肝丙肝是第二位，酒精性肝硬化排在第三，还有其它的原因等等，从流行病学调查，大家都是公认除了以上因素以外，我们饮用水的污染，也是重要的原因之一，黄曲霉毒素包括我们的饮食，包括我们的食物，食品，粮食等等，那么最主要的原因还是乙肝，我们国家毕竟它是一个乙肝大国。
那么通过乙肝到肝硬化，大约10年-15年的时间，那么从肝硬化发展成肝癌，一部分患者会发展成肝癌大约需要5年-10年的时间在肝硬化基础上，肝硬化有肝硬化结节，假小叶形成的肝硬化结节，这肝硬化结节随着疾病的进展和演变，它就会变成腺瘤一样的增生不典型增生，这个时候呢在超声下，我们会看到超声回声粗糙并且有结节，或者点状回声粗糙的回声，在CT核磁下我们也可以看到高信号结节，那这个结节在我们还没有确诊肿瘤之前，严密观察，因为不知道什么时候，它可能会合并演变为肝癌，因此肝硬化结节是后来转变肝癌的重要途径，因此我们对发现肝脏有结节占位要高度重视。
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