如果是轻度的缺磷通常没有明显的症状，严重的低磷血症可以导致严重的临床后果，但是症状没有明显的特异性。症状主要是分为以下几种：
第一就是神经精神症状表现为烦躁不安或者是感觉异常，严重的患者可以出现精神错乱、抽搐、昏迷、甚至死亡。
第二方面会出现心脑血管系统的症状，严重的低磷患者可以导致能量代谢障碍进一步发展，导致严重的心肌病变，会出现心排血量降低、低血压、充血性心衰等，有的人还会出现心率减慢或者是心肌缺血，心肌供血不足，严重的还会因为心律失常，导致心源性猝死。
另外还会出现消化系统的症状，慢性低磷血症常常会出现食欲不振、消化吸收不良、厌油、泛酸、恶心、腹胀、腹泻等；还会出现肌肉骨骼方面的症状，主要表现为骨质疏松、骨软化、易骨折，小孩会出现佝偻病；还会出现肌肉萎缩的情况。
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