先天性卵圆孔未闭可引起矛盾性栓塞，导致脑血管血栓，造成偏头痛、视物模糊、黑朦，导致急性脑梗死发作；同时也可以引起冠状动脉血栓，出现胸闷、气短、胸疼等症状，导致急性心肌梗死发作。
先天性卵圆孔未闭无分流或分流量小时不影响正常生活，但如果出现并发症的卵圆孔未闭患者，一般来说积极治疗恢复后对生活也是无影响的。
先天性卵圆孔未闭无明显症状且无并发症时，无治疗意义，定期门诊随访即可。
出现不明原因型缺血性脑卒中、短暂性脑缺血发作、顽固或慢性偏头痛等并发症的卵圆孔未闭患者，需药物治疗（如抗凝药物：阿司匹林、氯吡格雷等）和手术治疗（如经心导管卵圆孔未闭封堵术和经胸外科修补卵圆孔未闭等）。
建议出现先天性卵圆孔未闭的患者要及时到正规医院心血管内科检查，明确病因后在医生的指导下进行对症治疗，以免耽误治疗。
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