部分患者在使用布拉氏酵母菌散之后会出现一些副作用，主要会出现有全身的过敏反应，有荨麻疹，还可能会出现有胃肠道的副作用，表现为顽固性的便秘，口干，比较罕见的是出现有全身的真菌血症以及血液循环系统的副作用，表现为血管性的水肿。
通常对这个药物成分有过敏反应的患者是禁止服用的，对果糖不耐受的患者以及有先天性半乳糖血症及葡萄糖，半乳糖吸收障碍综合征或者是有乳糖酶缺乏的患者都是禁止使用的，这个药物需要在医生指导下选择服用。
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