先天性甲状腺功能低下，在临床上主要是采用甲状腺激素制剂进行补充和替代治疗，但是治疗的效果是和发生先天性甲减的时间以及严重程度有关的。另外可以针对先天性甲低出现的并发症进行对症治疗。
如果是在婴幼儿时期，已经发生先天性甲低而没有进行良好的治疗，而现在已经达到了成年人，此时智力的恢复是比较困难的，应用甲状腺激素的补充和替代主要是缓解目前的甲低状态，改善患者的一般情况，但是智力很难恢复正常。而如果是在成年后发生的甲状腺功能低下，在青少年时期并不明显，这种情况可以在应用甲状腺激素补充和替代后恢复原有的最好的智力情况。
所以，一旦发现先天性甲状腺功能低下，应该尽早的进行治疗。对于已经伴有并发症的情况，比如心脏的问题，则需要进行对症治疗。
先天性甲状腺功能低下能治好吗
先天性甲状腺功能低下，是由于甲状腺的先天发育异常，造成了分泌甲状腺激素过少，血FT3、FT4明显下降，TSH增高，表现为代谢率降低，身体发育异常，有些还会出现智力发育障碍，称为矮小症或者克丁病。应该说先天性甲状腺功能减退，没有根治或治愈的方法，需要终身替代左甲状腺素钠片，来进行治疗，并且越早治疗，甲状腺激素补充的越及时，带来的不良结局和影响就越小。大于2岁发现才治疗的，智力落后将不可逆，同时随着季节的变化，生长发育的阶段，身体对甲状腺素的需求是不同的，要定期复查甲状腺激素，及时调整用药剂量。
什么是先天性甲状腺功能减低症
先天性甲状腺功能减低症，是指婴儿出生时甲状腺功能是减退的、甲状腺激素是分泌不足的。
先天性甲状腺功能减低症原因是多种多样的，主要跟母体在妊娠期的甲状腺功能异常、服用了甲状腺药物、遗传因素有很大的关系。甲状腺激素是促进代谢的，除了增加机体的代谢，也能够促进脑部的发育和骨骼的发育。所以甲状腺激素有促进生长和智力发展的作用，先天性甲状腺功能减低的话，会造成婴儿生长发育不良、智力低下，叫做呆小症。如果不治疗的话，或者是不及早发现的话，患儿会出现智力低下、身材矮小，一般婴儿在出生的时候就检测足跟血，足跟血中可以检测甲状腺激素。在妊娠期母亲服用甲状腺激素时，婴儿在出生的时候，体内可能还有母体的甲状腺激素，有时候不能检测，需要在两周之后，进行甲状腺激素的复检，以便筛出更多的先天性甲状腺功能减退的患儿。
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