儿童结膜炎的类型不同引起的原因也不同，比如儿童的细菌性结膜炎大部分情况下是由于被其他的细菌性结膜炎的患者传染所导致的，当周围人群有细菌性结膜炎的患者时，如果儿童不注意个人卫生，接触了患者的眼部的分泌物则有可能会被传染上细菌性结膜炎，有时甚至可以在幼儿园，学校等集体中造成流行性的传播。
而病毒性结膜炎则常见于儿童患感冒等疾病，导致身体免疫力下降时发生病毒性结膜炎。过敏性结膜炎则是由于儿童在接触了一些外源性或内源性的过敏原之后导致的过敏反应。
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