虽然甲钴胺和腺苷钴胺都是维生素B12中的一种，但还是有区别的。
一，结构上的差别：甲钴胺在中心钴离子的β位上连接的是甲基，而腺苷钴胺连接的是5-脱氧核糖腺苷。
二，药效上的差别：虽然两者都是辅酶B12，都能参与人体内的生化反应，但人体内有11种生化反应需要腺苷钴胺，而只有一种生化反应需要甲钴胺，虽说只有一种生化反应需要甲钴胺，而正是这一种生化反应与神经组织的活动有密切关系，所以甲钴胺是治疗神经疾病最好的B12。
三，吸收上的差别：甲钴胺的吸收速度明显快于腺苷钴胺，这是被许多国外学者证实的事实，而且人体内的细胞可以根据需要把任何一种B12转变为自己需要的形式。因此，这就有了任何一种B12的功能都基本相同，只是效果有些差异罢了。
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