生殖器疱疹通过其典型的临床表现以及结合实验室检查，如生殖器单纯疱疹病毒DNA检查是可以明确诊断的，临床上是很少有误诊的。
生殖器疱疹典型的临床表现有生殖器部位出现集簇性水疱、痛、痒，有时可以引起浅表组织的溃疡和糜烂，往往会同时伴有局部的腹股沟淋巴结肿大，甚至会出现发热、乏力等症状。通过其病毒DNA检查是可以进一步明确诊断的。
在急性发病期时是需要口服抗病毒药物来治疗的，临床上常用的抗病毒药物有阿昔洛韦，伐昔洛韦等。
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