重组疫苗是通过遗传学技术，将抗原成分重组而制成，灭活疫苗是通过物理或化学手段，将病原微生物灭活而制成的疫苗，区别在于制备方法不同、抗原来源不同、接种剂次不同。
1、制备方法不同：重组疫苗制备方法有很多，如重组蛋白疫苗技术，在非致病性微生物体内插入病原体基因，而后转入其他细胞内进行繁殖表达，最终制成重组疫苗；而灭活疫苗是利用射线等物理手段，或甲醛等化学手段，对病原体进行处理，使病原体失去病毒活性，但保留免疫原性的一种疫苗。
2、抗原来源不同：重组疫苗主要是通过在其他细胞内繁殖后产生的抗原蛋白，注射进入机体内发挥免疫作用；灭活疫苗是一种死疫苗，在体内并无繁殖能力，主要是通过产生病原微生物的抗原，对免疫细胞产生刺激作用，使机体出现特异性免疫细胞，从而达到免疫效果。
3、接种剂次不同：重组疫苗通常接种三剂次，间隔时间约4周及以上；灭活疫苗通常需要接种两剂次，间隔时间约3周。
新冠蛋白疫苗和灭活疫苗的区别
新冠蛋白疫苗医学上称为新冠重组蛋白疫苗，灭活疫苗即新冠灭活疫苗，二者区别主要在于制备方法、抗原来源和接种剂次等。
1、制备方法不同：
新冠灭活疫苗是利用射线等物理手段，或甲醛等化学手段，对病原体进行处理，使病原体失去病毒活性，但保留免疫原性的一种疫苗；而新冠重组蛋白疫苗制备方法有很多，如重组蛋白疫苗技术等，将某种病毒的目的抗原基因构建在表达载体上，将已构建的表达蛋白载体转化到细菌或昆虫等细胞中，在一定的诱导条件下，表达出大量的抗原蛋白，通过纯化后制备的疫苗。
2、抗原来源不同：
新冠灭活疫苗是一种死疫苗，在体内并无繁殖能力，主要是通过其表面抗原，对免疫细胞产生刺激作用，使机体出现特异性免疫细胞，从而达到免疫效果；而新冠重组蛋白疫苗主要是通过在其他细胞内繁殖后产生的抗原蛋白，注射进入机体内发挥免疫作用。
3、接种剂次不同：
新冠灭活疫苗通常需要接种两剂次，间隔时间约3周；新冠重组蛋白疫苗通常接种三剂次，间隔时间约4周及以上。
疫苗和血清的区别
疫苗和血清有一定的区别，疫苗主要是主动免疫，而血清主要是被动免疫。
血清就是抗体血清，是一种提炼含有抗体的血清制剂，而疫苗是经过灭活或者减毒处理的各种细菌或病毒制成的，主要是预防接种的生物制品，在机体可以刺激人体产生相应的抗体来抵御疾病，主要起预防疾病的作用，而血清主要是增强人体的抵抗力，可在短时间内起作用，可以和病毒对抗，可以用于治疗某种感染性疾病。
二者在功效方面有一定的区别，比如被狗咬狗后可以接种狂犬疫苗，也可以接种狂犬免疫球蛋白。
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