治疗先天性胸腺发育不全可以采用一般疗法、抗感染疗法、免疫替补疗法、对症疗法等。
1、一般疗法：
日常生活中可以给患者多吃一些营养丰富的食物，有利于增强抵抗力和免疫力，同时还要注意个人卫生，避免接种牛豆疫苗、冻干卡介疫苗等活疫苗，也不可以接种麻疹和脊髓灰质炎疫苗。
2、抗感染疗法：
先天性胸腺发育不全的患者可能会由于免疫力低下容易引起病毒或真菌等病原体入侵，一旦出现了感染，一定要及时的在医生的指导下服用阿昔洛韦胶囊、盐酸伐昔洛韦胶囊，或伊曲康唑胶囊、氟康唑胶囊等药物进行抗感染治疗。
3、免疫替补疗法：
免疫替补疗法主要是补充T淋巴细胞和增强T细胞的功能，比如可以输注新鲜全血，也可以通过做骨髓移植治疗等。
4、对症疗法：
如果患者出现了手足搐搦，可以通过使用葡萄糖酸钙注射液进行控制。
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