甲硝唑葡萄糖注射液的禁忌主要包括患有活动性中枢神经系统疾患和血液病的患者应禁用本品。孕妇及哺乳期妇女也禁用本品。需要注意的是本品可抑制酒精代谢，患者在用药期间应戒酒，如果饮酒可能会出现腹痛、呕吐、头痛等不良症状。
对原患有肝脏疾病的患者，本品的使用剂量应减少。如果在使用本品期间出现运动失调或其他中枢神经系统症状时应停药。重复一个疗程之前，应做白细胞计数检查。厌氧菌感染合并肾功能衰竭的患者，给药间隔时间应由8小时延长至12小时。
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