菌群失调症是由于长期使用抗生素和滥用抗生素，机体某些部位的正常菌群中各种细菌的正常比例发生变化称为菌群失调。
例如长期使用抗生素治疗腹泻的病人可使肠内正常的大肠埃希菌数大量减少，而导致金黄色葡萄球菌及白假丝酵母菌大量繁殖，引起假膜性肠炎，此类疾病称为菌群失调症。为防止菌群失调症的发生，在临床工作中必须合理使用抗生素。
什么是肠道菌群失调
如果机体的内外环境的变化使肠道的正常菌群生理组合遭到了破坏，产生了病理性的组合，就称为肠道菌群失调。肠道菌群失调所致的慢性腹泻是临床上比较常见的症状，肠道菌群失调如果出现要积极的进行治疗，一般调整肠道菌群可以服用一定的益生菌，或者积极的采用中医中药的方法进行身体的综合调养。
除了身体的调养之外，还可以进行生活上的改善，要注意饮食，不要吃辛辣、寒凉等刺激性的食物。要注意增加运动，保证睡眠，增强免疫力，来预防肠道菌群失调。
菌群失调怎么调节
菌群失调的意思是在某种原因的影响下，正常菌群内微生物的种类和数量发生变化，菌群之间相互制约所形成的平衡被打破。临床上比较常见的有消化道菌群失调、阴道菌群失调等。菌群失调可以通过药物治疗、食物疗法等方式进行调节，也可以配合益生菌等类型药物进行联合用药治疗。
肠道炎症性疾病是引起消化道菌群失调的常见病症，立即停止原抗生素，应根据菌群分析以及抗菌药物敏感试验，选用合适的抗生素以及抑制过度繁殖的细菌，从而间接扶植肠道繁殖不足的细菌如头孢克肟、阿奇霉素等；活菌制剂有嗜酸乳杆菌、保加利亚乳杆菌等有效的抑制对人体有害菌的生长。选择有助于改善肠胃功能的食物，如酸奶、山药、苹果等。
阴道菌群失调，首先观察有没有症状。如果平常没有症状，注意生活方式就可以，如不能冲洗阴道，合理的饮食、避免高糖食物摄入等；如有瘙痒、白带异常等不适，可以经阴道补充微生态制剂，如乳酸杆菌栓等促使恢复，防止继发感染；如果已经合并其他类型的感染，比如滴虫、霉菌等，需要进行相应抗炎治疗，使用甲硝唑或者制霉菌素等。
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